社會發展中網絡起到了重要的作用，少兒醫保也可以在網上申報了。在網絡上可以查詢到參保人的基本信息、少兒醫療保險費與制卡費托收到帳情況以及社會保障卡制卡等情況。只要在網上申報少兒醫保就可以享受這些便利的方式，但很多家長都不知道少兒醫保網上申報的具體流程是怎樣的。
深圳市少兒醫保網上申報可分為三類兒童：在校兒童;不在校兒童;港澳臺外籍人員、軍人家屬子女(深戶和非深戶)、烈士家屬子女(非深戶)等其他人群。
第一類人群——在園在校的學生：學生及其監護人要在學校將學生基本資料申報成功后才可以在個人網上申報系統中申報。學生及其監護人接到學校上網通知后，可以在個人網上申報系統的登錄窗口中選擇“首次參保”，通過錄入參保人的身份證號登錄，并按系統提示錄入相關參保信息。提交成功后，如有打印條件的，可直接打印出“登記表”，無打印條件的，填寫“登記表”，再將登記表與登記表內所注明的“應提供的材料”一并交到學校。
第二類人群——不在園不在校的少兒：監護人在個人網上申報系統的登錄窗口中選擇“首次參保”，可直接通過參保人的身份證號登錄，并錄入相關參保信息。提交成功后，如有打印條件的，可直接打印出“登記表”，無打印條件的，填寫“登記表”，再將登記表與登記表內所注明的“應提供的材料”一并交到參保人(監護人)在深住所附近的且有與社保機構簽定協辦協議的街道或社區(系統中可查詢到)。
第三類人群——參保人是港澳臺外籍人員、軍人家屬子女(深戶和非深戶)、烈士家屬子女(非深戶)等其他人群：監護人到所在地社保機構領取“深圳市少兒醫療保險參保登記表”，填寫后將“登記表”與登記表內所注明的“應提供的材料”一并交到所在地社保機構辦理有關參保手續，網上不可申報。